Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnd1Q03719 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms