Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tff2Q03404 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tff2Q03404 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms