Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Crisp3Q03402 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms