Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Thbs2Q03350 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms