Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ddr1Q03146 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddr1Q03146 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms