Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Epha4Q03137 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Epha4Q03137 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms