Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PrkczQ02956 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PrkczQ02956 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms