Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mmp11Q02853 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms