Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col6a2Q02788 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms