Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GscQ02591 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GscQ02591 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GscQ02591 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GscQ02591 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GscQ02591 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms