Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnb1Q02248 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnb1Q02248 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms