Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ascl1Q02067 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms