Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RykQ01887 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RykQ01887 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RykQ01887 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RykQ01887 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RykQ01887 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms