Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HmgcrQ01237 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms