Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SelpQ01102 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SelpQ01102 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms