Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbp1Q00915 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbp1Q00915 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms