Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Serpina1cQ00896 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Serpina1cQ00896 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms