Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SeleQ00690 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms