Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
F8a1Q00558 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms