Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GabpaQ00422 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GabpaQ00422 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms