Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pax8Q00288 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms