Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp10Q000W5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp10Q000W5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms