Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shc1P98083 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shc1P98083 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shc1P98083 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shc1P98083 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shc1P98083 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shc1P98083 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms