Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
rp9P97762 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
rp9P97762 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
rp9P97762 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
rp9P97762 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms