Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tarbp2P97473 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tarbp2P97473 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms