Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkp1P97350 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pkp1P97350 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms