Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vgll3P85442 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll3P85442 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms