Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Atf1P81269 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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