Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctps1P70698 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctps1P70698 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms