Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9xP70398 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9xP70398 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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