Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad50P70388 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad50P70388 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad50P70388 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms