Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgif1P70284 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgif1P70284 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms