Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sycp3P70281 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms