Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp7P70280 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp7P70280 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms