Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn1P70268 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkn1P70268 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms