Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd13P70217 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms