Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Plxna3P70208 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Plxna3P70208 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms