Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza3P70190 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza3P70190 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza3P70190 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capza3P70190 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capza3P70190 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Capza3P70190 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms