Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gtf2bP62915 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2bP62915 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms