Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vsnl1P62761 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vsnl1P62761 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms