Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snrpd2P62317 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms