Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Rps29P62274 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms