Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lmo4P61969 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lmo4P61969 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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