Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg6P61406 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg6P61406 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms