Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2iP60898 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms