Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap25P60879 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snap25P60879 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snap25P60879 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms