Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ppfia3P60469 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfia3P60469 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms