Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eif3eP60229 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eif3eP60229 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms