Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ythdf1P59326 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ythdf1P59326 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms