Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtpaP58389 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtpaP58389 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtpaP58389 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtpaP58389 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms